Santiago Castillo Ramírez

Genómica Evolutiva Investigador
Unidad de Análisis Bioinformáticos Investigador

Inv. Tit. A T.C. Interino

Semblanza

Santiago Castillo cursó la licenciatura en Biología (graduado con mención honorífica) en la Universidad de Guadalajara. Posteriormente estudió la maestría (mayo 2005) y el doctorado (noviembre 2009) en Ciencias Bioquímicas en la UNAM. En su doctorado Santiago trabajó filogenómica de bacterias y realizó un par de estancias de investigación en el laboratorio del Profesor Scott V. Edwards en la Universidad de Harvard, donde condujo simulaciones para analizar estrategias de muestro en la inferencia de filogenias de especies. En 2009, fue merecedor de la Medalla Alfonso Caso por ser el graduado más distinguido del Programa de Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Después Santiago llevo a cabo dos estancias posdoctorales con el Profesor Edward J Feil, en la Universidad de Bath, en Inglaterra; durante ese tiempo, el Dr. Castillo utilizó datos genómicos obtenidos con plataformas de secuenciación de segunda generación para estudiar la micro evolución y filogeografía de diversos patógenos bacterianos. Actualmente, Santiago es Investigador Titular A del Centro de Ciencias Genómicas (CCG) de la UNAM y forma parte del Sistema Nacional de Investigadores con nivel 2.

Santiago ha sido pionero en la genómica poblacional y evolutiva de patógenos bacterianos en el país. En particular, el estudia la distribución de poblaciones bacterianas a lo largo del tiempo y el espacio, y cómo se genera la variación genética en los patógenos nosocomiales Acinetobacter Baumannii y Staphylococcus Aureus. A la fecha ha publicado más de 27 de artículos en diversas revistas indizadas -algunos en las revistas más prestigiosas del área de la genómica como Genome Biology y Genome Research- y varios capítulos de libro. Por otro lado, el es editor asociado de la revista Bioscience Horizons (área de genómica) y Review Editor de la revista Frontiers in Microbiology, sección Evolutionary and Genomic Microbiology. Además, ha sido invitado numerosas veces como revisor por reconocidas revistas en las áreas de genómica (Genome Biology and Evolution), microbiología (Applied Environmental Microbiology), evolución (Molecular Biology and Evolution, Molecular Ecology, Infection, Genetics and Evolution) y enfermedades infecciosas (Lancet Infectious Diseases). Adicionalmente, el ha evaluado proyectos en las convocatorias de Ciencia Básica del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, y Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (en México), y del NSERC Discovery grants (Canadá).

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Publicaciones selectas

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Correo: iago@ccg.unam.mx

Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
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2009Martinez-Salazar, Jaime M., Sandoval-Calderon, Mario, Guo, Xianwu, Castillo-Ramirez, Santiago, Reyes, Alma, Loza, Maria G., Rivera, Javier, Alvarado-Affantranger, Xochitl, Sanchez, Federico, Gonzalez, Victor, Davila, Guillermo, Ramirez-Romero, Miguel A. (2009) The Rhizobium etli RpoH1 and RpoH2 sigma factors are involved in different stress responses MICROBIOLOGY-SGM 155(2):386-397 [doi:10.1099/mic.0.021428-0]19202087
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2008Crossman, Lisa C., Castillo-Ramirez, Santiago, McAnnula, Craig, Lozano, Luis, Vernikos, Georgios S., Acosta, Jose L., Ghazoui, Zara F., Hernandez-Gonzalez, Ismael, Meakin, Georgina, Walker, Alan W., Hynes, Michael F., Young, J. Peter W., Downie, J. Allan, Romero, David, Johnston, Andrew W. B., Davila, Guillermo, Parkhill, Julian, Gonzalez, Victor (2008) A common genomic framework for a diverse assembly of plasmids in the symbiotic nitrogen fixing bacteria Plos One 3(7):e2567- [doi:10.1371/journal.pone.0002567]18596979
2008González Zúñiga, Víctor Manuel, Luis Lozano, Santiago Castillo-Ramírez, Hernández González, Ismael Luis, Bustos Arcos, Virginia Patricia, Santamaria Gutiérrez, Rosa Isela, Fernandez Vázquez, José Luis, Centro de Ciencias Genómicas CCG, Dávila Ramos, José Guillermo (2008) Evolutionary Genomics of the Nitrogen Fixing Symbiotic Bacteria Molecular Mechanisms of Plant-Microbe Coexistance Soil Biology Series 15(0):183-198
2007Guo, Xianwu, Castillo-Ramirez, Santiago, Gonzalez, Victor, Bustos, Patricia, Fernandez-Vazquez, Jose Luis, Santamaria, Rosa Isela, Arellano, Jesus, Cevallos, Miguel A., Davila, Guillermo (2007) Rapid evolutionary change of common bean (Phaseolus vulgaris L) plastome, and the genomic diversification of legume chloroplasts Bmc Genomics 8():228-228 [doi:10.1186/1471-2164-8-228]17623083
2006González, V., Santamaría, R.I., Bustos, P., Acosta, J.L., Fernández, J.L., Hernández-González, I., Lozano, L., Castillo, S., Dávila, G. (2006) Genomic diversity of Rhizobium etli: The Complete Genome and its -intraspecific-variation Revista latinoamericana de microbiología 48(2):132-134