Luis Fernando Lozano Aguirre Beltrán

Unidad de Análisis Bioinformáticos Técnico Académico

Tec. Acad. Tit. B T.C. Obra Det.

Semblanza

Estudió Biología en la Faculta de Ciencias de la UNAM. En 2002 ingresó a la maestría en el Posgrado en Ciencias Bioquímicas en el Instituto de Biotecnología de la UNAM donde realizó un análisis bioinformático sobre la evolución de estructuras secundarias de familias de proteínas. En 2005 ingresó al doctorado en el Posgrado en Ciencias Biomédicas en el Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM donde realizó un estudio sobre la evolución de secuencias de inserción en poblaciones de bacterias simbiontes. Desde un principio se ha interesado en estudiar la evolución molecular mediante la aplicación de herramientas de biología computacional. Desde el 2011 ha trabajado en distintos proyectos en colaboración con los Programas del Centro de Ciencias Genómicas, junto con otras universidades e institutos nacionales. Ha impartido cursos a nivel nacional e internacional sobre el análisis de datos de secuenciación masiva. Actualmente, dentro de la Unidad de Análisis Bioinformáticos del Centro de Ciencias Genómicas, se ha interesado y especializado en estudios Genómicos y Transcriptómicos de procariontes y eucariontes, y en análisis de muestras metagenómicas de distintos orígenes.

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Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
2018Casasola-Rodriguez, Beatriz, Ruiz-Palacios, Guillermo M., Pilar, Ramos-Cervantes, Losano, Luis, Ignacio, Monje-Ramirez and Orta de Velasquez, Maria Teresa. (2018). "Detection of VBNC Vibrio Cholerae by RT-Real Time PCR based on differential gene expression analysis". Fems Microbiology Letters. 365(15):-. [doi:10.1093/femsle/fny156]29961811
2018Guerrero-Castro, Julio, Lozano, Luis and Sohlenkamp, C. (2018). "Dissecting the acid stress response of Rhizobium tropici CIAT 899". Frontiers in Microbiology. 9(APR):846-846. [doi:10.3389/fmicb.2018.00846]29760688
2018Seulveda-Cisternas, Ignacio, Lozano Aguirre, Luis, Fuentes Flores, Andres, Solis de Ovando, Ignacio Vasquez and Antonio Garcia-Angulo, Victor. (2018). "Transcriptomics reveals a cross-modulatory effect between riboflavin and iron and outlines responses to riboflavin biosynthesis and uptake in &ITVibrio Cholerae&IT". SCIENTIFIC REPORTS. 8(1):3149-3149. [doi:10.1038/s41598-018-21302-3]29453341
2018Julieta Solis-Gonzalez, Claudia, Dominguez-Malfavon, Lilianha, Vargas-Suarez, Martin, Gaytan, Itzel, Angel Cevallos, Miguel, Lozano, Luis, Javier Cruz-Gomez, M. and Loza-Tavera, Herminia. (2018). "Novel metabolic pathway for N-methylpyrrolidone degradation in Alicycliphilus sp. strain BQ1". Applied And Environmental Microbiology. 84(1):e02136-17-. [doi:10.1128/AEM.02136-17]29030443
2017Ortiz-Berrocal, Marlene, Lozano, Luis, Sanchez-Flores, Alejandro, Nava, Noreide, Hernandez, Georgina and Reddy, Pallavolu M.. (2017). "Expression in rice of an autoactive variant of Medicago truncatula DMI3, the Ca+2/calmodulin-dependent protein kinase from the common symbiotic pathway modifies root transcriptome and improves mycorrhizal colonization". PLANT BIOTECHNOLOGY REPORTS. 11(5):271-287. [doi:10.1007/s11816-017-0449-4]
2017Graña-Miraglia L, Lozano LF, Velázquez C, Volkow-Fernández P, Pérez-Oseguera Á, Cevallos MA and Castillo-Ramirez, S. (2017). "Rapid gene turnover as a significant source of genetic variation in a recently seeded population of a healthcare-associated pathogen". Frontiers in Microbiology. 8(SEP):1817-1817. [doi:10.3389/fmicb.2017.01817]28979253
2017Steffani-Vallejo, J.L., Zuñiga, C., Cruz-Morales, P., Lozano, L., Morales, M., Licona-Cassani, C., Revah, S. and Utrilla, J.. (2017). "Draft genome sequence of Sphingobacterium sp. CZ-UAM, isolated from a methanotrophic consortium". Genome Announcements. 5(33):e00792-17-. [doi:10.1128/genomeA.00792-17]28818899
2017Santamaría RI, Bustos P, Pérez-Carrascal OM, Miranda-Sánchez F, Vinuesa P, Martínez-Flores I, Juárez S, Lozano L, Martínez-Romero E, Cevallos MÁ, Romero D, Dávila G, Ormeño-Orrillo E and González V. (2017). "Complete genome sequences of eight Rhizobium symbionts associated with common bean (Phaseolus vulgaris)". Genome Announcements. 5(30):e00645-17-. [doi:10.1128/genomeA.00645-17]28751391
2017Moreno-Avitia, F., Lozano, L., Utrilla, J., Bolívar, F. and Escalante, A.. (2017). "Draft genome sequence of pseudomonas chlororaphis ATCC 9446, a nonpathogenic bacterium with bioremediation and industrial potential". Genome Announcements. 5(23):e00474-17-. [doi:10.1128/genomeA.00474-17]28596401
2017Hernandez-Vargas, Maria J., Gil, Jeovanis, Lozano, Luis, Pedraza-Escalona, Martha, Ortiz, Ernesto, Encarnacion-Guevara, Sergio, Alagon, Alejandro and Corzo, Gerardo. (2017). "Proteomic and transcriptomic analysis of saliva components from the hematophagous reduviid Triatoma Pallidipennis". Journal Of Proteomics. 162():30-39. [doi:10.1016/j.jprot.2017.04.022]28442446
2017Cossío-Bayúgar R., Miranda-Miranda E., Arreguín-Pérez C.A., Lozano L., Peréz de la Rosa D., Rocha-Martínez M.K., Bravo-Díaz M.A. and Sachman-Ruiz B.. (2017). "Draft genome sequence of Enterococcus casseliflavus PAVET15 obtained from the oviduct infection of the cattle tick (Rhipicephalus microplus) in jiutepec, morelos, Mexico". Genome Announcements. 5(16):e00196-17-. [doi:10.1128/genomeA.00196-17]
2017Bustos P, Santamaría RI, Pérez-Carrascal OM, Acosta JL, Lozano L, Juárez S, Martínez-Flores I, Martínez-Romero E, Cevallos MÁ, Romero D, Dávila G, Vinuesa P, Miranda F, Ormeño E and González V. (2017). "Complete genome sequences of three Rhizobium gallicum symbionts associated with common bean (Phaseolus vulgaris)". Genome Announcements. 5(11):e00030-17-. [doi:10.1128/genomeA.00030-17]28302777
2017Salgado-Morales R., Rivera-Gómez N., Lozano-Aguirre Beltrán L.F., Hernández-Mendoza A. and Dantán-González E.. (2017). "Draft genome sequence of a pseudomonas Aeruginosa NA04 bacterium isolated from an entomopathogenic nematode". Genome Announcements. 5(36):e00746-17-. [doi:10.1128/genomeA.00746-17]
2016Ramírez-Puebla ST, Ormeño-Orrillo E, Vera-Ponce de León A, Lozano L, Sanchez-Flores A, Rosenblueth M and Martínez-Romero E. (2016). "Genomes of Candidatus Wolbachia bourtzisii wDacA and Candidatus Wolbachia pipientis wDacB from the cochineal insect Dactylopius coccus (Hemiptera: Dactylopiidae)". G3-GENES GENOMES GENETICS. 6(10):3343-3394. [doi:10.1534/g3.116.031237]27543297
2016Degli Esposti M, Cortez D, Lozano L, Rasmussen S, Nielsen HB and Martinez Romero E. (2016). "Alpha proteobacterial ancestry of the [Fe-Fe]-hydrogenases in anaerobic eukaryotes". Biology Direct. 11(1):34-34. [doi:10.1186/s13062-016-0136-3]27473689
2016Santillán O, Ramírez-Romero MA, Lozano L, Checa A, Encarnación SM and Dávila G. (2016). "Region 4 of Rhizobium etli primary sigma factor (SigA) confers transcriptional laxity in Escherichia coli". Frontiers in Microbiology. 7(JUL):1078-1078. [doi:10.3389/fmicb.2016.01078]27468278
2016Garza-Ramos U, Silva-Sánchez J, Catalán-Nájera J, Barrios H, Rodríguez-Medina N, Garza-González E, Cevallos MA and Lozano L. (2016). "Draft genome sequence of a hypermucoviscous extended-spectrum-ß-lactamase-producing Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae clinical isolate". Genome Announcements. 4(4):e00475-16-. [doi:10.1128/genomeA.00475-16]27389261
2016Castro-Jaimes S., Salgado-Camargo A.D., Gra�a-Miraglia L., Lozano L., Bocanegra-Ibarias P., Volkow-Fern�ndez P., Silva-Sanchez J., Castillo-Ramirez, S and Cevallos M.A.. (2016). "Complete genome sequence of a multidrug-resistant Acinetobacter Baumannii isolate obtained from a Mexican hospital (sequence type 422)". Genome Announcements. 4(3):e00583-16-. [doi:10.1128/genomeA.00583-16]
2016Mucito-Varela E., Castillo-Rojas G., Cevallos M.A., Lozano L., Merino E., L�pez-Leal G. and L�pez-Vidal Y.. (2016). "Complete genome sequence of Helicobacter Pylori strain 7C isolated from a Mexican patient with chronic gastritis". Genome Announcements. 4(1):e01503-15-. [doi:10.1128/genomeA.01503-15]
2016Graña-Miraglia L., Lozano L., Castro-Jaimes S., Cevallos M.A., Volkow P. and Castillo-Ramirez, S. (2016). "First genome sequence of a mexican multidrug-resistant Acinetobacter Baumannii isolate". Genome Announcements. 4(2):e00156-16-. [doi:10.1128/genomeA.00156-16]
2015Lozano, Luis, Santamaria Gutiérrez, Rosa Isela and Bustos, P. (2015). "Genomic Tools for the Study of Azospirillum and Other Plant Growth-Promoting Rhizobacteria". Handbook for Azospirillum: Technical Issues and Protocols. ():83-97. [doi:10.1007/978-3-319-06542-7_5]
2014Rogel, M.A., Bustos, P., Santamaría, R.I., González, V., Romero, D., Cevallos, M.T., Lozano, L., Castro-Mondragón, J., Martínez-Romero, J., Ormeño-Orrillo, E. and Martínez-Romero, E.. (2014). "Genomic basis of symbiovar mimosae in Rhizobium etli". Bmc Genomics. 15(1):575-575. [doi:10.1186/1471-2164-15-575]25005495
2014Garcia-Angulo, Victor A., Kalita, Anjana, Kalita, Mridul, Lozano, Luis and Torres, Alfredo G.. (2014). "Comparative genomics and immunoinformatics approach for the identification of vaccine candidates for enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7". Infection And Immunity. 82(5):2016-2026. [doi:10.1128/IAI.01437-13]24595137
2014Althabegoiti, M.J., Ormeño Orrillo, Ernesto Aldo, Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Tejerizo, G.T., Rogel Hernández, Marco Antonio, Mora Celis, Jaime and Martínez Romero, María Esperanza. (2014). "Characterization of Rhizobium Grahamii extrachromosomal replicons and their transfer among Rhizobia". Bmc Microbiology. 14(1):6-6. [doi:10.1186/1471-2180-14-6]24397311
2014Santamaria Gutiérrez, Rosa Isela, Bustos Arcos, Virginia Patricia, Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Rodríguez Sánchez, César, Fernandez Vázquez, José Luis, Juárez Ramírez, María Soledad, Kameyama, L., Guarneros, G., Dávila Ramos, José Guillermo and González Zúñiga, Víctor Manuel. (2014). "Narrow-Host-Range Bacteriophages That Infect Rhizobium etli Associate with Distinct Genomic Types". Applied And Environmental Microbiology. 80(2):446-454. [doi:10.1128/AEM.02256-13]24185856
2012Althabegoiti, M.J., Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Torres-Tejerizo, G., Ormeño Orrillo, Ernesto Aldo, Rogel Hernández, Marco Antonio, González Zúñiga, Víctor Manuel and Martínez Romero, María Esperanza. (2012). "Genome sequence of Rhizobium Grahamii CCGE502, a broad-host-range symbiont with low nodulation competitiveness in Phaseolus vulgaris". Journal Of Bacteriology. 194(23):6651-6652. [doi:10.1128/JB.01785-12]23144400
2012Wisniewski-Dye, Florence, Lozano, Luis, Acosta-Cruz, Erika, Borland, Stephanie, Drogue, Benoit, Prigent-Combaret, Claire, Rouy, Zoe, Barbe, Valerie, Mendoza Herrera, Alberto, Gonzalez, Victor and Mavingui, Patrick. (2012). "Genome sequence of Azospirillum brasilense CBG497 and comparative analyses of Azospirillum core and accessory genomes provide insight into niche adaptation". Genes. 3(4):576-602. [doi:10.3390/genes3040576]24705077
2012Tejerizo, G.T., Lozano, L, Gonzalez, V, Bustos, P, Romero, D and Brom, S. (2012). "Draft genome sequence of the bean-nodulating Sinorhizobium fredii strain GR64". Journal Of Bacteriology. 194(24):6978-6978. [doi:10.1128/JB.01882-12]23209231
2012Cancino-Rodezno, A., Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Oppert, C., Castro, J.I., Lanz-Mendoza, H., Encarnación Guevara, Sergio Manuel, Evans, A.E., Gill, S.S., Soberon, M., Jurat-Fuentes, J.L. and Bravo, A.. (2012). "Comparative proteomic analysis of Aedes Aegypti larval midgut after intoxication with Cry11Aa toxin from Bacillus thuringiensis". Plos One. 7(5):37034-. [doi:10.1371/journal.pone.0037034]22615881
2012Mavingui, P., Van, T.V., Wisniewski-Dye, F., Raquin, V., Minard, G., Tran, F.H., Voronin, D., Rouy, Z., Bustos Arcos, Virginia Patricia, Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Barbe, V. and González Zúñiga, Víctor Manuel. (2012). "Whole-genome sequence of Wolbachia strain wALbB, an endosymbiont of tiger mosquito vector Aedes albopictus". Journal Of Bacteriology. 194(7):1840-1840. [doi:10.1128/JB.00036-12]22408242
2011Villaseñor Toledo, Tomas, Dávalos Rodríguez, Araceli Elvira, Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Romero Camarena, David René and García de los Santos, Alejandro. (2011). "Housekeeping genes essential for pantothenate biosynthesis are plasmid-encoded in Rhizobium etli and Rhizobium leguminosarum". Bmc Microbiology. 11():66-66. [doi:10.1186/1471-2180-11-66]21463532
2010Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Hernández González, Ismael Luis, Bustos Arcos, Virginia Patricia, Santamaria Gutiérrez, Rosa Isela, Souza, V., Young, J.P.W, Dávila Ramos, José Guillermo and González Zúñiga, Víctor Manuel. (2010). "Evolutionary dynamics of insertion sequences in relation to the evolutionary histories of the chromosome and symbiotic plasmid genes of Rhizobium etli populations". Applied And Environmental Microbiology. 76(19):6504-6513. [doi:10.1128/AEM.01001-10]20675442
2008Crossman, Lisa C., Castillo-Ramirez, S, McAnnula, Craig, Lozano, Luis, Vernikos, Georgios S., Acosta, Jose L., Ghazoui, Zara F., Hernandez-Gonzalez, Ismael, Meakin, Georgina, Walker, Alan W., Hynes, Michael F., Young, J. Peter W., Downie, J. Allan, Romero, David, Johnston, Andrew W. B., Davila, Guillermo, Parkhill, Julian and Gonzalez, Victor. (2008). "A common genomic framework for a diverse assembly of plasmids in the symbiotic nitrogen fixing bacteria". Plos One. 3(7):e2567-. [doi:10.1371/journal.pone.0002567]18596979
2008González Zúñiga, Víctor Manuel, Luis Lozano, Castillo-Ramirez, S, Hernández González, Ismael Luis, Bustos Arcos, Virginia Patricia, Santamaria Gutiérrez, Rosa Isela, Fernandez Vázquez, José Luis, CCG and Dávila Ramos, José Guillermo. (2008). "Evolutionary Genomics of the Nitrogen Fixing Symbiotic Bacteria". Molecular Mechanisms of Plant-Microbe Coexistance Soil Biology Series. 15(0):183-198.
2006González, V., Santamaría, R.I., Bustos, P., Acosta, J.L., Fernández, J.L., Hernández-González, I., Lozano, L., Castillo-Ramirez, S and Dávila, G.. (2006). "Genomic diversity of Rhizobium etli: The Complete Genome and its -intraspecific-variation". Revista Latinoamericana De Microbiologia. 48(2):132-134.