José Utrilla Carreri

Biología de Sistemas y Biología Sintética Investigador

Inv. Asoc. C T.C. Interino

Semblanza

El Dr. José Utrilla Carreri es Ingeniero bioquímico de formación, realizó sus estudios doctorales en el grupo de Ingeniería Metabólica del Instituto de Biotecnología de la UNAM. Experto en ingeniería metabólica, biología de sistemas y sintética. Ha llevado a cabo la generación de cepas de producción y su aplicación en procesos a nivel piloto con la colaboración de industrias nacionales. Llevó a cabo una estancia postdoctoral en el grupo de biología de sistemas de la Universidad de California en San Diego bajo la dirección del Prof. Bernhard O Palsson, donde estudió las relaciones genotípo-fenotípo con la ayuda de modelos computacionales a escala genómica en cepas de Escherichia coli obtenidas por evolución adaptativa. En noviembre del 2014 se incorporó al Centro de Ciencias Genómicas como investigador Asociado “C”, es miembro del Sistema Nacional de Investigadores nivel I, y es tutor del posgrado en ciencias biomédicas de la UNAM. Actualmente dirige tesis de licenciatura, maestría y doctorado. Sus temas específicos de investigación incluyen el diseño de herramientas computacionales a escala genómica para la optimización de cepas microbianas de producción. El diseño de fenotipos sintéticos a traves de la manipulación de la red de regulación. La ingeniería de las maquinarias transcripcional y traduccional de Escherichia coli para la distribución de recursos celulares a funciones sintéticas. El Dr. Utrilla también está involucrado en varias colaboraciones para desarrollar nuevos organismos como chasis de producción, en aplicaciones multi-escala de biología sintética y en la investigación del uso de fuentes de carbono alternativas para la bioproducción sustentable de diversos químicos.

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Correo: utrilla@ccg.unam.mx

Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
2017Steffani-Vallejo, J.L., Zuñiga, C., Cruz-Morales, P., Lozano, L., Morales, M., Licona-Cassani, C., Revah, S., Utrilla, J. (2017) Draft Genome Sequence of Sphingobacterium sp. CZ-UAM, Isolated from a Methanotrophic Consortium. Genome announcements 5(33):e00792-17- [doi:10.1128/genomeA.00792-17]28818899
2017Moreno-Avitia, F., Lozano, L., Utrilla, J., Bolívar, F., Escalante, A. (2017) Draft Genome Sequence of pseudomonas chlororaphis ATCC 9446, a Nonpathogenic Bacterium with Bioremediation and Industrial Potential. Genome announcements 5(23):e00474-17- [doi:10.1128/genomeA.00474-17]28596401
2017Utrilla, Jose (2017) Evolutionary Engineering of Microorganisms to Overcome Toxicity During Lignocellulose Hydrolysates Utilization Engineering of Microorganisms for the Production of Chemicals and Biofuels from Renewable Resources ():181-200 [doi:https://doi.org/10.1007/978-3-319-51729-2_7]
2016Utrilla, Jose, Vargas-Tah, Alejandra, Trujillo-Martinez, Berenice, Gosset, Guillermo, Martinez, Alfredo (2016) Production of D-lactate from sugarcane bagasse and corn stover hydrolysates using metabolic engineered Escherichia coli strains BIORESOURCE TECHNOLOGY 220():208-214 [doi:10.1016/j.biortech.2016.08.067]27573474
2016O'Brien EJ, Utrilla J, Palsson BO (2016) Quantification and Classification of E-coli Proteome Utilization and Unused Protein Costs across Environments Plos Computational Biology 12(6):e1004998- [doi:10.1371/journal.pcbi.1004998]27351952
2016Utrilla, J., O'Brien, E.J., Chen, K., McCloskey, D., Cheung, J., Wang, H., Armenta-Medina, D., Feist, A.M., Palsson, B.O. (2016) Global Rebalancing of Cellular Resources by Pleiotropic Point Mutations Illustrates a Multi-scale Mechanism of Adaptive Evolution Cell systems 2(4):260-271 [doi:10.1016/j.cels.2016.04.003]27135538