Programas instalados en los servidores del CCG y de la LCG


ÁreaSistema Operativo
NombreDescripción corta
Adobe Acrobat 9 Standard
Artemis

Visualización y anotación de genomas.

BIOBASE

Bases de datos de regulación, señales de transducción y vias metabólicas.

BLAST

Comparación de secuencias de nucleótidos y proteínas.

Consed / Autofinish

Visualiza, edita y termina ensamble de secuencias.

Consensus / Wconsensus / Patser

Analiza y determina DNA.

Cytoscape

Cytoscape is an open source bioinformatics software platform for visualizing molecular interaction networks and integrating these interactions with gene expression profiles and other state data.

EMBOSS

Paquete de programas para análisis de biología molecular.

FASTA

Comparación rápida de proteinas o nucleótidos.

Glimmer

Encuentra genes en DNA microbiano.

HMMER

Busca patrones en secuencias usando descripciones estadísticas

Jmol

Jmol: an open-source Java viewer for chemical structures in 3D

Lamarc

Estimation of recombination rate, migration rate, effective population sizes and exponential growth rates

Maq

Maq stands for Mapping and Assembly with Quality. It builds assembly by mapping short reads to reference sequences.

MEME/MAST

Descubre motivos(regiones altamente conservadas) en grupos de DNA relacionados o proteinas de secuencias