Carlos Francisco Méndez Cruz

Genómica Computacional Investigador

Inv. Asoc. C T.C. Obra Det.

Semblanza

Carlos-Francisco Méndez-Cruz estudió la Licenciatura en informática en la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) y obtuvo su título en 1997. Trabajó para el Patronato universitario por siete años, comenzando como programador de computadoras y terminando como jefe del área de tecnología de información. Sus intereses se movieron hacia el Procesamiento de lenguaje natural y la Lingüística computacional y comenzó sus estudios de posgrado en 2005. Obtuvo grado de maestría y doctorado en lingüística de la UNAM. Su proyecto doctoral fue sobre aprendizaje no supervisado de la morfología del español y recibió su título doctoral en 2013. Hizo investigación postdoctoral en el Instituto de Ingeniería de la UNAM de 2014 a 2015 en perfilamiento de autor, procesamiento de noticias y el desarrollo de una biblioteca digital de arte mexicano. Actualmente tiene un puesto como Investigador asociado C en el Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM dentro del Programa de Investigación en Genómica Computacional.
El objetivo de su trabajo es la extracción de conocimiento de literatura biomédica mediante métodos de procesamiento de lenguaje natural y minería de textos. Este conocimiento extraído es usado por investigadores de ciencias de la vida para formular nuevos planes de investigación, y por biocuradores para alimentar bases de datos biológicas como RegulonDB. Sus proyectos en marcha son “Resumen automático de propiedades de factores transcripcionales”, “Extracción automática de interacciones regulatorias y condiciones de crecimiento” y “Extracción automática de eventos gene-enfermedad en enfermedades pulmonares”. También coordina el desarrollo de una nueva infraestructura de curación con capacidades de minería de textos como colaborador en un proyecto del Dr. Julio Collado (NIGMS-NIH).
Ha sido profesor desde el 2000 en programas de maestría (Lingüística e Informática administrativa) y licenciatura (Lingüística, Ingeniería en computación, Informática). Sus últimos cursos impartidos han sido “Introducción al procesamiento de lenguaje natural en literatura biomédica” e “Introducción a la minería de textos en literatura biomédica” en la Licenciatura en Ciencias Genómicas. Adicionalmente, ha supervisado varias tesis de licenciatura y una de maestría.

Ligas

OrcID

Publicaciones selectas

Méndez-Cruz, C.-F., Gama-Castro, S., Mejía-Almonte, C., Castillo-Villalba, M.-P., Muñiz-Rascado, L.-J. and Collado-Vides, Julio (2017). First steps in automatic summarization of transcription factor properties for RegulonDB: classification of sentences about structural domains and regulated processes. Database, Vol. 2017: article ID bax070. PMID: 29220462.
Méndez-Cruz, C. F., Medina-Urrea, A., & Sierra, G. (2016). Unsupervised morphological segmentation based on affixality measurements. Pattern Recognition Letters, 84, 127-133. DOI: 10.1016/j.patrec.2016.09.001.
Méndez-Cruz, C. F., Torres-Moreno, J. M., Medina, A. y Sierra, G. (2013). Extrinsic Evaluation on Automatic Summarization Tasks. Testing Affixality Measurements for Statistical Word Stemming. En I. Batyrshin y M. González Mendoza (Eds.), Advances in Computational Intelligence, MICAI 2012, Part II (LNAI Vol. 7630, pp. 46-57). Heidelberg: Springer. ISBN 978-3-642-37797-6, ISSN 0302-9743.

Teléfono: (777) 3132063
Correo: cmendezc@ccg.unam.mx

Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
2017Rinaldi F, Lithgow O, Gama-Castro S, Solano H, Lopez A, Muñiz Rascado LJ, Ishida-Gutiérrez C, Méndez-Cruz CF, Collado-Vides J (2017) Strategies towards digital and semi-automated curation in RegulonDB DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION 2017(1):bax012- [doi:10.1093/database/bax012]28365731
2017Méndez-Cruz CF, Gama-Castro S, Mejía-Almonte C, Castillo-Villalba MP, Muñiz-Rascado LJ, Collado-Vides J (2017) First steps in automatic summarization of transcription factor properties for RegulonDB: classification of sentences about structural domains and regulated processes. DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION 2017():- [doi:10.1093/database/bax070]29220462
2016Mendez-Cruz, Carlos-Francisco, Medina-Urrea, Alfonso, Sierra, Gerardo (2016) Unsupervised morphological segmentation based on affixality measurements PATTERN RECOGNITION LETTERS 84():127-133 [doi:10.1016/j.patrec.2016.09.001]