Alejandro García de los Santos

Ingeniería Genómica Investigador

Inv. Tit. A T.C. Interino

Semblanza

Dr. Alejandro García de los Santos, Investigador Titular A de tiempo completo en el Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM.
El Dr. Alejandro García de los Santos inició su carrera científica en la Facultad de Ciencias de la UNAM donde estudió Biología. En su tesis de licenciatura estudió la degradación de celulosa por enzimas microbianas. Posteriormente, recibió la oportunidad de trabajar en Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno (hoy Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM) para organizar el cepario del departamento de genética molecular. Más tarde, comenzó a trabajar con la Dra. Susana Brom estudiando el papel de los plásmidos en la plasticidad genómica de la bacteria fijadora de nitrógeno Rhizobium etli. También contribuyó en el aislamiento de mutantes de Rhizobium etli que espontáneamente pierden plásmidos a alta frecuencia. La Dra. Susana Brom dirigió su tesis de doctorado en la cual caracterizo dos genes indispensables para la síntesis de lipopolisacárido (lps) un componente de la membrana externa necesario para la colonización de su planta hospedera.
Sus estudios posdoctorales los llevó a cabo en la Universidad de Calgary en Canadá en el laboratorio de Michael Hynes buscando genes de Rhizobium leguminosarum cuya expresión genética es activada por azúcares presentes en la pared celular de su planta hospedera.
De regreso al laboratorio de la Dra. Brom, Alejandro y sus colegas descubrieron la presencia de enzimas del metabolismo primario codificados en plásmidos, algo inusual ya que estos genes se localizan en el cromosoma. Estos datos contribuyeron a definir un nuevo tipo de replicón denominado cromido. El estudio de las vías metabólicas de los rhizobios reveló la ausencia de algunas enzimas claves de la síntesis de vitaminas. Actualmente, Alejandro está reconstruyendo la vía de síntesis de pantotenato.
En los últimos cinco años, el trabajo del Dr. Alejandro se ha centrado en caracterizar el transportoma de iones metálicos divalentes (el repertorio de proteínas que participan en el ingreso, tráfico interno y expulsión de metales). Las publicaciones más recientes del grupo del Dr. García reportan la caracterización de los genes que codifican transportadores de la familia CDF ( catión diffusion facilitators) que transportan niquel, cobalto y manganeso. También reportó una proteína tipo porina que participa en el ingreso de cobre en R. etli y un análisis in sílico sobre la ocurrencia, diversidad y evolución de ATPasas de tipo PIB en el orden Rhizobiales.
Los nuevos proyectos del Dr. García tienen como meta hacer un análisis global de la respuesta a metales utilizando RNA seq bajo la hipótesis de que la interacción metal-bacteria induce cambios a diferentes niveles de la estructura celular: polisacáridos de superficie, membrana externa, espacio periplásmico, membrana interna, citoplasma, etc.

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Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
2018González-Sánchez A, Cubillas CA, Miranda F, Dávalos A and García-de Los Santos A. (2018). "The ropAe gene encodes a porin-like protein involved in copper transit in Rhizobium etli CFN42". MICROBIOLOGYOPEN. 7(3):e00573-. [doi:10.1002/mbo3.573]29280343
2017Cubillas, C., Miranda-Sánchez, F., González-Sánchez, A., Elizalde, J.P., Vinuesa, P., Brom, S. and García-de los Santos, A.. (2017). "A comprehensive phylogenetic analysis of copper transporting P1BATPases from bacteria of the Rhizobiales order uncovers multiplicity, diversity and novel taxonomic subtypes". MICROBIOLOGYOPEN. 6(4):e00452-. [doi:10.1002/mbo3.452]28217917
2014Cubillas, Ciro, Vinuesa, Pablo, Tabche, Maria Luisa, Davalos, Araceli, Vazquez, Alejandra, Hernandez-Lucas, Ismael, Romero, David and Garcia-de los Santos, Alejandro. (2014). "The cation diffusion facilitator protein EmfA of Rhizobium etli belongs to a novel subfamily of Mn<sup>2+</sup>/Fe<sup>2+</sup> transporters conserved in a-proteobacteria". Metallomics. 6(10):1808-1815. [doi:10.1039/c4mt00135d]25054342
2014Chang, F.M.J., Coyne, H.J., Cubillas Ramírez, Ciro Alberto, Vinuesa Fleischmann, Pablo, Fang, X.Y., Ma, Z., Ma, D.J., Helmann, J.D., García de los Santos, Alejandro, Wang, Y.X., Dann, C.E. and Giedroc, D.P.. (2014). "Cu(I)-mediated allosteric switching in a copper-sensing operon repressor (CsoR)". JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 289(27):19204-19217. [doi:10.1074/jbc.M114.556704]24831014
2013Cubillas Ramírez, Ciro Alberto, Vinuesa Fleischmann, Pablo, Tabche, M.L. and García de los Santos, Alejandro. (2013). "Phylogenomic analysis of Cation Diffusion Facilitator proteins uncovers Ni2+/Co2+ transporters". Metallomics. 5(12):1634-1643. [doi:10.1039/c3mt00204g]24077251
2011Villaseñor Toledo, Tomas, Dávalos Rodríguez, Araceli Elvira, Lozano Aguirre Beltrán, Luis Fernando, Romero Camarena, David René and García de los Santos, Alejandro. (2011). "Housekeeping genes essential for pantothenate biosynthesis are plasmid-encoded in Rhizobium etli and Rhizobium leguminosarum". Bmc Microbiology. 11():66-66. [doi:10.1186/1471-2180-11-66]21463532
2008Garcfa-de los Santos, Alejandro, Lopez, Erika, Cubillas, Ciro A., Noel, K. Dale, Brom, Susana and Romero, David. (2008). "Requirement of a plasmid-encoded catalase for survival of Rhizobium etli CFN42 in a polyphenol-rich environment". Applied And Environmental Microbiology. 74(8):2398-2403. [doi:10.1128/AEM.02457-07]18310436
2007Ramirez-Trujillo, J. A., Encarnacion, S., Salazar, E., de los Santos, A. Garcia, Dunn, M. F., Emerich, D. W., Calva, E. and Hernandez-Lucas, I.. (2007). "Functional characterization of the Sinorhizobium meliloti acetate metabolism genes aceA, SMc00767, and glcB". Journal Of Bacteriology. 189(16):5875-5884. [doi:10.1128/JB.00385-07]17526694
2007Brom, Susana, Garcia-De Los Santos, Alejandro and Romero, Laura Cervantes David. (2007). "Conjugative transfer of Rhizobium plasmids.". Plasmid. 57(2):220-220.
2007Romero, David, Garcia-De Los Santos, Alejandro and Brom, Susana. (2007). "Essential plasmids in Rhizobium.". Plasmid. 57(2):227-227.
2005Guillen-Navarro, K, Araiza, G, Garcia-de los Santos, A, Mora, Y and Dunn, MF. (2005). "The Rhizobium etli bioMNY operon is involved in biotin transport". Fems Microbiology Letters. 250(2):209-219. [doi:10.1016/j.femsle.2005.07.020]16099603
2004Brom Klanner, Susana, Girard Cuesy, María de Lourdes, Tun Garrido, Cristina Soleda, García de los Santos, Alejandro, Bustos Arcos, Virginia Patricia, González Zúñiga, Víctor Manuel and Romero Camarena, David René. (2004). "Transfer of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42 requires cointegration with p42a, which may be mediated by site-specific recombination". Journal Of Bacteriology. 186(22):7538-7548. [doi:10.1128/JB.186.22.7538-7548.2004]15516565
2003Vargas, MD, Encarnacion, S, Davalos, A, Reyes-Perez, A, Mora, Y, Garcia-de los Santos, A, Brom, S and Moral, J. (2003). "Only one catalase, katG, is detectable in Rhizobium etli, and is encoded along with the regulator OxyR on a plasmid replicon". MICROBIOLOGY-SGM. 149(5):1165-1176. [doi:10.1099/mic.0.25909-0]12724378
2002Garcia-de los Santos, A, Morales, A, Baldoma, L, Clark, SRD, Brom, S, Yost, CK, Hernandez-Lucas, I, Aguilar, J and Hynes, MF. (2002). "The glcB locus of Rhizobium leguminosarum VF39 encodes an arabinose-inducible malate synthase". Canadian Journal Of Microbiology. 48(10):922-932. [doi:10.1139/w02-091]12489782
2002Brom Klanner, Susana, Girard Cuesy, María de Lourdes, García de los Santos, Alejandro, Sanjuan-Pinilla, J.M., Olivares, J. and Sanjuan, J.. (2002). "Conservation of plasmid-encoded traits among bean-nodulating Rhizobium species". Applied And Environmental Microbiology. 68(5):2555-2561. [doi:10.1128/AEM.68.5.2555-2561.2002]11976134
2000Brom, S, Garcia-de los Santos, A, Cervantes, L, Palacios, R and Romero, D. (2000). "In Rhizobium etli symbiotic plasmid transfer, nodulation competitivity and cellular growth require interaction among different replicons". Plasmid. 44(1):34-43. [doi:10.1006/plas.2000.1469]10873525
1999Wang, ET, Roel, MA, Garcia-de los Santos, A, Martinez-Romero, Julio, Cevallos, MA and Martinez-Romero, E. (1999). "Rhizobium etli bv. mimosae, a novel biovar isolated from Mimosa affinis". INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY. 49(4):1479-1491. [doi:10.1099/00207713-49-4-1479]10555329
1997GarciadelosSantos, A and Brom, S. (1997). "Characterization of two plasmid-borne lps beta loci of Rhizobium etli required for lipopolysaccharide synthesis and for optimal interaction with plants". Molecular Plant-Microbe Interactions. 10(7):891-902. [doi:10.1094/MPMI.1997.10.7.891]9304861
1992BROM, S, DELOSSANTOS, AG, STEPKOWSKI, T, FLORES, M, DAVILA, G, ROMERO, D and PALACIOS, R. (1992). "DIFFERENT PLASMIDS OF Rhizobium-leguminosarum BV phaseoli ARE REQUIRED FOR OPTIMAL SYMBIOTIC PERFORMANCE". Journal Of Bacteriology. 174(16):5183-5189. [doi:10.1128/jb.174.16.5183-5189.1992]1644746
1991BROM, S, DELOSSANTOS, AG, DELOURDESGIRARD, M, DAVILA, G, PALACIOS, R and ROMERO, D. (1991). "High-frequency rearrangements in Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli plasmids". Journal Of Bacteriology. 173(3):1344-1346. [doi:10.1128/jb.173.3.1344-1346.1991]1991727